这两种格式，最初想解决的问题就不一样。
一句话概括，PDF是「把纸原样带走」的格式，EPUB是「在屏幕上舒服地读」的格式。无所谓孰优孰劣，只是目的不同。
差距最明显的场合，是用手机阅读的时候。
按A4尺寸做的PDF在手机上打开，依然是A4。 缩到屏幕里字就变小，放大了又得横向滚动。这不是PDF的缺陷，而是「固定版式」这一设计本来的行为。
换成EPUB的重排型，文字会按屏幕宽度重新排布。 读者把字调大，也只是页数变多，阅读体验依然保持。
| EPUB（重排型） | ||
|---|---|---|
| 改变字号 | 读者可自由调整 | 只能缩放 |
| 手机上的阅读体验 | 舒适 | 取决于制作方式 |
| 版面的还原度 | 随环境变化 | 始终一致 |
| 朗读功能 | 容易支持 | 取决于制作方式 |
| 打印 | 不太适合 | 拿手 |
能不能改字号，直接关系到有多少人读得了这本书。对视力不佳的人和年长的读者来说，字放不大的书就是读不了的书。
如果作品以文字为主却选了PDF，这一点值得放在心上。
制作的工夫也不一样。
Word、Illustrator之类手边的软件可以直接导出。如果是精心排版的同人志，或者想把送印刷厂的数据原样发出去，PDF要省事得多。
以文字为主的作品，EPUB带给读者的体验更好。不过结构必须搭对，所以基本上要用专门的工具。
另外，EPUB还有一个好处是事后好改。里面是HTML和CSS，改文字、调设计都不必重做版面。
这里其实可能才是左右选择的最大因素。
也就是说，「在哪里发布」一旦定下来，格式也就定了一半。 拿不定主意时，先确认发布方的要求是最快的路。
从作品的性质来判断，是这样的。
实在难以判断时，标准很简单。
「读者是在屏幕上读，还是打印在纸上？」
在屏幕上读就选EPUB，要印在纸上就选PDF。像漫画那样既在屏幕上读、又想保住版面的，EPUB的固定版式可以同时满足两边。
如果实在犹豫，两种都发也是一个选择。
实际上，同人志的发布中经常能看到把「打印用PDF」和「屏幕用EPUB」放在一起的做法。读者可以按自己的阅读方式挑，制作方也不必非要二选一。
虽然多了一道工序，但只要原稿相同，不过是多转换一次。视作品的性质，这值得考虑。